多相催化反应机理的 DFT 研究
利用周期性密度泛函理论,在电子结构层面揭示固体催化剂表面的吸附、活化与转化过程。通过过渡态搜索与能量分析确定可行的反应路径,并识别其中的速控步骤。
Computational Chemistry · DFT · Heterogeneous Catalysis
计算化学研究者 / Computational Chemist
中国科学院大学 (University of Chinese Academy of Sciences)⚠️
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我是范守配(Shoupei Fan),一名从事计算化学研究的科研工作者。我的工作聚焦于多相催化反应的微观机理,主要借助密度泛函理论(DFT),从电子结构层面理解催化剂表面的吸附、活化与转化过程。
目前的研究重点之一是 MoS₂ 基催化剂的 CO₂ 加氢制甲醇反应网络。我以 Hu et al., Nat. Catal. 4, 242 (2021) 的工作为蓝本,尝试复现并理解其中的反应路径,关注不同硫空位构型对催化行为的影响,并系统计算各基元步骤的吸附能与反应能垒。
除了具体体系的研究,我也关注计算流程本身的工程化:从 Linux 与高性能计算环境的日常使用,到基于 Shell 与 Python 的自动化任务提交、数据后处理与可视化。我自建了一台计算服务器用于日常的 DFT 计算与测试,也乐于把其中积累的经验整理与分享。
以下方向围绕「从原子尺度理解并设计催化过程」展开,兼顾方法本身与具体反应体系。
利用周期性密度泛函理论,在电子结构层面揭示固体催化剂表面的吸附、活化与转化过程。通过过渡态搜索与能量分析确定可行的反应路径,并识别其中的速控步骤。
关注 MoS₂ 等二维过渡金属硫化物的表面缺陷化学,研究硫空位的形成、稳定性及其对反应物吸附与活化的调控作用,理解缺陷结构与催化活性之间的关联。
以 CO₂ 加氢制甲醇等反应为对象,探索催化剂结构与活性、选择性之间的构效关系,为低碳转化过程与催化剂的设计提供理论依据。
将 VASP 计算与 pymatgen、ASE、Python 脚本相结合,构建涵盖结构生成、批量提交、数据解析与可视化的一体化流程,提高计算的效率与可复现性。
日常使用的主要工具与方法,覆盖从建模、计算到后处理的完整链路。
结构优化、过渡态搜索(NEB / CI-NEB)、态密度与能带计算、频率分析,以及表面与吸附体系的第一性原理计算。
结构建模与对称性分析,批量生成与解析 VASP 输入输出文件,搭建可脚本化的计算流程。
Ubuntu 环境管理、并行任务配置与作业调度,针对内存带宽与并行效率进行参数调优。
批量任务提交、日志解析与结果汇总,把重复性操作脚本化,保证流程可复现。
用 Python 绘制能量剖面、吸附能趋势与态密度图,把计算结果转化为可读的机理图像。
交换关联泛函的选择、范德华修正的引入,以及 k 点网格与平面波截断能的收敛性测试。
当前工作围绕 MoS₂ 基催化剂的 CO₂ 加氢制甲醇反应网络展开,目标是复现并梳理完整的反应路径。
以 Hu et al., Nat. Catal. 4, 242 (2021) 为蓝本,构建 MoS₂ 表面的 CO₂ 加氢制甲醇反应网络,梳理各中间体与基元步骤之间的连接关系。
对比双硫空位与三硫空位等缺陷构型的形成能与相对稳定性,评估其作为活性位点对反应物吸附与活化的调控作用。
计算反应网络中每一步的吸附能、过渡态能垒与反应能,构建完整能量剖面并识别速控步骤;同时对 CO₂、H₂、CH₃OH、H₂O 等气相参考分子进行能量计算,保证热力学参考的一致性。
日常的 DFT 计算在自建的服务器上完成,配置以内存带宽和并行效率为优先考量。
| 处理器 | AMD EPYC 7642(48 核) |
|---|---|
| 内存 | 64 GB DDR4 ECC |
| 存储 | Kioxia 1 TB NVMe SSD + 14 TB HDD |
| 操作系统 | Ubuntu 24.04 LTS |
| 计算软件 | VASP 6.3.2,编译自 Intel oneAPI(ifx + MKL + Intel MPI) |
| 内存带宽 | STREAM Triad 实测约 86 GB/s |
论文列表整理中,敬请期待。
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